香港境內錄得多達88種石質珊瑚、6種黑珊瑚、29種軟珊瑚和38種柳珊瑚。珊瑚對海水溫度及水質非常敏感。本港沒有形成廣闊的珊瑚礁，但有直接在岩石上生長的珊瑚群落。
本港大部分珊瑚分布在東邊，覆蓋率達21.9%至79.4%，因其喜鹽分濃度高、乾淨的水質。漁護署於早前公布香港珊瑚礁普查結果，發現由北面的東平洲至南面果洲群島，珊瑚覆蓋範圍由12.8%至74.3%不等，且珊瑚色素平均指數為4.28，比過去的4.06稍佳，遠高於一般平均值的3，顯示整體珊瑚健康狀況良好。
珊瑚是珊瑚蟲和其體內海藻的共生體，健康的珊瑚呈現美麗顏色其實是體內海藻的顏色。若面臨持續幾周的2攝氏度左右的海水升溫，珊瑚蟲便會將海藻排出體外，造成珊瑚白化現象。近年全球變暖，珊瑚白化現象加劇。
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